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染色質免疫沉淀的DNA適用于多種分析方法
點擊次數:617 更新時間:2022-07-22
  染色質免疫沉淀技術的原理是:在生理狀態下把細胞內的DNA與蛋白質交聯在一起,通過超聲或酶處理將染色質切為小片段后,利用抗原抗體的特異性識別反應,將與目的蛋白相結合的DNA片段沉淀下來。染色質免疫沉淀技術一般包括細胞固定,染色質斷裂,染色質免疫沉淀,交聯反應的逆轉,DNA的純化,以及DNA的鑒定。因為ChIP實驗涉及的步驟多,結果的重復性較低,所以對ChIP實驗過程的每一步都應設計相應的對照,而且對結果的分析也需要有一定的經驗。
  染色質免疫沉淀的DNA適用于多種分析方法。如果目的蛋白的靶序列是已知的或需要驗證的,可采用狹縫雜交(Slotblot)的方法,把靶序列特異性探針與染色質免疫沉淀的DNA雜交,來驗證目的蛋白與DNA靶序列的特異性結合。還可以根據靶序列設計引物,用半定量PCR的方法進行測定,或采用Real-timePCR方法進行定量分析。如果目的蛋白的靶序列是未知的或高通量的(high-throughput),可采用Southern雜交。但因為免疫沉淀的DNA量較少,所以在研究時通常要用PCR方法擴增DNA探針,再進行整個基因組掃描。還可以把沉淀的DNA克隆到載體中,進行測序,尋找該序列附近的開放閱讀框,發現新的基因調節序列。

滬公網安備 31011802001676號

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